Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab42Q0PD08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab42Q0PD08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms