Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ttc21bQ0HA38 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttc21bQ0HA38 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc21bQ0HA38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms