Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc7a1Q09143 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc7a1Q09143 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc7a1Q09143 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms