Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ssrp1Q08943 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssrp1Q08943 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssrp1Q08943 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms