Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnma1Q08460 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnma1Q08460 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms