Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tgm3Q08189 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgm3Q08189 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms