Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnn1Q08091 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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