Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
F13bQ07968 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
F13bQ07968 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms