Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atf4Q06507 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf4Q06507 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms