Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrx2Q06348 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prrx2Q06348 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms