Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fmn1Q05860 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fmn1Q05860 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Fmn1Q05860 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms