Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelbQ04863 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RelbQ04863 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelbQ04863 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelbQ04863 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelbQ04863 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms