Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smpd1Q04519 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms