Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cacna1sQ02789 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1sQ02789 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1sQ02789 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms