Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VcpQ01853 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VcpQ01853 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VcpQ01853 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VcpQ01853 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms