Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna1cQ01815 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cacna1cQ01815 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms