Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mc1rQ01727 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms