Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Top2aQ01320 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms