Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Grin2bQ01097 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Grin2bQ01097 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms