Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pde1bQ01065 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms