Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Serpina1eQ00898 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Serpina1eQ00898 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1eQ00898 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1eQ00898 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1eQ00898 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms