Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms