Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Flt3Q00342 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Flt3Q00342 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms