Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax8Q00288 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms