Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp6P97868 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms