Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra1P97785 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms