Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4cP97470 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms