Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas1P97459 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas1P97459 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas1P97459 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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