Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LystP97412 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LystP97412 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LystP97412 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LystP97412 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LystP97412 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LystP97412 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LystP97412 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LystP97412 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LystP97412 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LystP97412 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LystP97412 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LystP97412 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LystP97412 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LystP97412 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LystP97412 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LystP97412 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LystP97412 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LystP97412 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LystP97412 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LystP97412 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms