Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b3P97370 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b3P97370 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b3P97370 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b3P97370 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b3P97370 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1b3P97370 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp1b3P97370 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp1b3P97370 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp1b3P97370 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms