Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pkp1P97350 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms