Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H3f3aP84244 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3f3aP84244 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms