Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx1P82976 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms