Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcaP82350 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms