Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TgfbiP82198 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TgfbiP82198 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TgfbiP82198 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms