Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cct7P80313 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms