Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-Q6P79568 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q6P79568 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms