Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx4P70452 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx4P70452 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx4P70452 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx4P70452 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms