Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms