Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tbx6P70327 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms