Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema3eP70275 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms