Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd13P70217 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Hoxd13P70217 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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Hoxd13P70217 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd13P70217 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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