Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig1P70193 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms