Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Actg1P63260 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actg1P63260 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actg1P63260 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms