Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sumo1P63166 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sumo1P63166 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sumo1P63166 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sumo1P63166 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo1P63166 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo1P63166 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo1P63166 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo1P63166 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo1P63166 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo1P63166 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sumo1P63166 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sumo1P63166 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sumo1P63166 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo1P63166 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo1P63166 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sumo1P63166 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms