Protein–RNA interactions for Protein: P63028

Tpt1, Translationally-controlled tumor protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpt1P63028 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpt1P63028 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpt1P63028 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpt1P63028 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpt1P63028 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpt1P63028 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpt1P63028 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpt1P63028 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpt1P63028 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpt1P63028 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpt1P63028 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpt1P63028 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpt1P63028 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpt1P63028 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpt1P63028 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpt1P63028 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpt1P63028 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpt1P63028 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpt1P63028 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpt1P63028 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpt1P63028 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpt1P63028 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpt1P63028 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms