Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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