Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl8P62918 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms