Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hpcal1P62748 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hpcal1P62748 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms