Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou3f4P62515 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou3f4P62515 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms